万国觉醒允许同时操作多支队伍，且是游戏核心玩法之一，解锁对应条件后可实现2-5队并行操作，配合多选与预设编队能大幅提升发育与作战效率。
解锁多队伍操作的核心门槛是市政厅等级，11级解锁第二队列，17级开启第四队列，21级开放第五队列，22级可稳定操控五支队伍。军事科技中的“军事扩张”可永久提升部队容量，优先研发能让多队配置更灵活。队列解锁后，每支队伍可独立配将、编兵，执行采集、打野、驻防、作战等不同任务，互不干扰。
野外大地图是多队操作的主要场景，核心操作简单易上手。长按主城拖动至目标，可勾选多支待命部队集体行军或攻击；双击屏幕任意己方部队，能快速选中视野内所有队伍统一调度，适合打野与集结作战；点击部队栏“开启多选”，可手动勾选目标队伍精准指挥。需注意多选功能仅野外生效，城内界面无法使用。
预设编队是多线操作的关键技巧，游戏支持15组快捷编队保存。可提前配置采集队（工兵+采集将）、打野队（骑兵+高攻将）、主力作战队（步兵+防御将）、驻防队等，执行任务时一键调用，省去重复编组时间。日常发育可分兵多线采集资源、同时打野刷怪；团战可分主力正面抗伤、骑兵侧翼包抄、机动队补位，多队协同形成战术优势。
高阶玩法可通过集团军系统突破单账号队伍上限，最多可统筹7队作战。玩家创建集团军后，盟友可加入并贡献队伍，由总指挥统一调度，适合KVK、要塞攻防等大型战役。集团军操作需注意避免误操作，如一键撤退可能导致非集团军队伍回撤、集团军滞留，需手动精准指挥。合理搭配多队与集团军，能兼顾发育效率与团战强度，是进阶玩家的核心必修课。
