剿灭指令的执行地图是游戏的主世界地图，具体针对的是在地图上随机出现的蛮族部队。玩家需要在大地图上直接点击出现的蛮族营地或部队，随后发布剿灭战令并派遣部队前往。蛮族并非永久存在于地图上，其功能开启需要服务器达成特定的皇图霸业目标，通常是在完成盛食厉兵后解锁。除了达成目标当天，蛮族一般仅在每周的周五和周六于地图上刷新出现，因此玩家需要留意游戏内的开启时间，在正确的时间段内寻找并剿灭他们。
游戏为玩家提供了可供操作和查看的高清主地图，其模式主要包括展现全局的九州大地图以及更为详细的郡治地图等，玩家可以通过地图清晰地定位自己城池与资源地的位置，也能观察到蛮族出现的具体坐标。剿灭行动的本质是玩家部队从己方城池或营地出发，在大地图上行军至蛮族所在位置并触发战斗的过程。尽管后续赛季可能会推出具有特殊地形的新剧本地图，例如北定中原剧本对汉中之战战场进行了缩放和细节重塑，但剿灭蛮族这一基础玩法所依托的地图环境，始终是这张动态变化的、承载所有玩家与NPC势力的主世界沙盘地图。
使用剿灭指令时，有几个基于地图互动的关键机制需要注意。剿灭行动会消耗执行部队武将的体力。当部队抵达蛮族所在地点后，只会与蛮族部队本身发生战斗，而不会与该地块上可能存在的资源地守军交战，这意味着玩家无需担心同时面对双重攻击，部队会优先打击蛮族目标。成功消灭蛮族后，玩家可以获得大量铜币作为奖励，并且之后可以针对该地块使用攻占指令去占领资源地，不过在发动攻占前，进行侦查以了解守军情况仍然是推荐的做法。
剿灭与另一常见指令扫荡虽然都涉及战斗，但发生的地图场景和目标截然不同。扫荡指令是针对玩家已经占领的资源地使用的，点击已占领的土地即可发布扫荡指令。扫荡同样消耗武将体力，但其战斗对象是该资源地的固定守军，主要目的是让武将获取经验值，而无法再次攻占该土地。剿灭是面向大地图上动态事件敌人（蛮族）的清除行动，而扫荡是面向己方占领地的重复练兵行为，两者对应的地图交互点和战斗逻辑有本质区别。
